مدیریت بهتر در مطالعه و استفاده بهینه از زمان و همچنین انجام مطالعه با وسعت بیشتر؛ در کارگاه روش تندخوانی ـ استاد اسدی
کارگاه روش تحقیق عمومی روش تحقیق کیفی، معرفی منابع و کتب مربوط به آن، ارائه مراحل پژوهش، ساختار یک پژوهش کلاسی و ساختار مقاله مناسب برای مجله
کارگاه روش تحقیق در منطق ، ملموس و کاربردی کردن و چگونگی استفاده از منطق در مباحث سطح بالا توسط استاد ابوالقاسمی
کارگاه روش تحصیل در سطح دو حوزه علمیه توسط استاد تاکی
جریانشناسی تکفیر و شناخت سلفیها و تبیین نسبت بین این دو و جایگاه آنها در جهان اسلام
کارگاه جایگاه کلام در استنباط فقهی استاد برزگر
کارگاه آشنایی با دانش اخلاق استاد عالم زاده نوری
کارگاه آشنایی با اصول نگارش و ویرایش توسط استاد رودگر
کارگاه احکام اجتماعی
کارگاه مدیریت زمان از مهمترین کارگاه های برگزار شده در معاونت پژوهشی مدرسه علمیه معصومیه می باشد که توسط استاد شهید دهقانی برگزار شد؛ فایل صوتی این کارگاه جهت استفاده طلاب در سایت مدرسه بارگذاری شده است.